This study was carried out to investigate the prevalence of Babesia bovis and B. bigemina in cattle in Erzurum region by Real Time PCR and to characterize the isolates molecularly. Totally 300 whole blood samples from clinically healthy cattle in different ages, sex and breeds were collected into the tubes with EDTA in 2011-2012. Following DNA extraction, Sybergreen and TaqMan probe based Real Time PCR analyses were carried out with B. bovis and B. bigemina primers amplifying msa-2c and rap-1 gene regions. Out of 300 samples, 28 (9.3%) and 17 (5.7%) were found to be infected with B.bovis and B. bigemina. No mix infection was found in the samples. Four of B. bovis and three of B. bigemina isolates were sequenced with respect to msa-2c and rap-1 gene regions for phylogenetic analyses. According to pairwise comparisons of B. bovis isolates, genetic distances were found as 0.6%, 2.3%, and 7.5%, among each other, some other isolates in Turkey, and in the world, respectively. In the phylogenetic analyses of B.bigemina, genetic differences were detected as 0.3% and 0.5% among each other and the other isolates in the world. In the statistical analyses of B. bovis and B. bigemina positive samples according to age, sex and breed of cattle no statistical significance (p>0.05) was founded according to age and breed while the statistical difference according to sex was found significant for B. bigemina (p<0.05), and not significant for B. bovis (p>0.05). In conclusion, the molecular characterization and the prevalence of B. bovis and B. bigemina in cattle in Erzurum region were determined by Real Time PCR. This is the first report on the molecular characterizations of B. bovis and B. bigemina in Erzurum region
Babesia bigemina, Babesia bovis, cattle, Erzurum, molecular characterization, Real Time PCR
Bu çalışma, Erzurum yöresi sığırlarında Babesia bovis ve B. bigemina yaygınlığının Real Time PCR ile araştırılması ve saptanan izolatların moleküler karakterizasyonları amacıyla yapılmıştır. Bu amaçla 2011-2012 tarihleri arasında farklı yaş, cinsiyet ve ırklarda, klinik olarak sağlıklı görünümlü toplam 300 sığırdan EDTA’lı tüplere tam kan örnekleri toplanmıştır. DNA ekstraksiyonunu takiben B. bovis ve B.bigemina için sırasıyla msa-2c ve rap-1 gen bölgelerine özgü primerlerle Sybergreen ve TaqMan prob bazlı Real Time PCR analizleri gerçekleştirilmiştir. İncelenen 300 kan örneğinin 28’inde (%9,3) B. bovis, 17’sinde (%5,7) B. bigemina saptanmıştır. Örneklerde miks enfeksiyona rastlanmamıştır. B. bovis pozitiflerden 4’ünün, B. bigemina pozitiflerden 3’ünün msa-2c ve rap-1 gen bölgelerine göre sekans analizleri yapılmıştır. B. bovis izolatlarının pairwise kıyaslamalarında kendi aralarında, Türkiye’den diğer bazı ve dünyadaki diğer izolatlarla aralarında sırasıyla %0,6, %2,3 ve %7,5 genetik farklılık belirlenmiştir. B. bigemina izolatlarının kendi aralarında %0,3 ve dünyadaki diğer izolatlarla aralarında %0,5 genetik farklılık saptanmıştır. B. bovis ve B. bigemina yönünden pozitif belirlenen örneklerin parazit türü temel alınarak sığırların yaş, cinsiyet ve ırk özelliklerine göre istatistiksel analizlerinde; yaş ve ırk özelliklerine göre istatistiksel bir farklılık belirlenmezken (p>0,05), cinsiyete bağlı farklılık B. bovis için önemsiz (p>0,05), B. bigemina için ise önemli (p<0,05) bulunmuştur. Sonuç olarak bu çalışmayla Erzurum yöresi sığırlarında ilk kez Real Time PCR tekniği ile B. bovis ve B. bigemina moleküler olarak karakterize edilmiş ve yaygınlıkları ortaya konmuştur
Babesia bigemina, Babesia bovis, Erzurum, moleküler karakterizasyon, Real Time PCR, sığır
Birincil Dil | İngilizce |
---|---|
Konular | Veteriner Cerrahi |
Diğer ID | JA22PG24SY |
Bölüm | Araştırma Makalesi |
Yazarlar |
|
Yayımlanma Tarihi | 1 Mart 2015 |
Yayınlandığı Sayı | Yıl 2015Cilt: 62 Sayı: 1 |
Bibtex | @editöre mektup { auvfd532434, journal = {Ankara Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi}, issn = {1300-0861}, eissn = {1308-2817}, address = {}, publisher = {Ankara Üniversitesi}, year = {2015}, volume = {62}, number = {1}, pages = {27 - 35}, doi = {10.1501/Vetfak\_0000002654}, title = {Investigation of Babesia bovis and Babesia bigemina in cattle by Real Time PCR and molecularcharacterization of the isolates}, key = {cite}, author = {Düzlü, Önder and Yıldırım, Alparslan and İnci, Abdullah and Avcıoğlu, Hamza and Balkaya, İbrahim} } |
APA | Düzlü, Ö. , Yıldırım, A. , İnci, A. , Avcıoğlu, H. & Balkaya, İ. (2015). Investigation of Babesia bovis and Babesia bigemina in cattle by Real Time PCR and molecularcharacterization of the isolates . Ankara Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi , 62 (1) , 27-35 . DOI: 10.1501/Vetfak_0000002654 |
MLA | Düzlü, Ö. , Yıldırım, A. , İnci, A. , Avcıoğlu, H. , Balkaya, İ. "Investigation of Babesia bovis and Babesia bigemina in cattle by Real Time PCR and molecularcharacterization of the isolates" . Ankara Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi 62 (2015 ): 27-35 <http://vetjournal.ankara.edu.tr/tr/pub/issue/43549/532434> |
Chicago | Düzlü, Ö. , Yıldırım, A. , İnci, A. , Avcıoğlu, H. , Balkaya, İ. "Investigation of Babesia bovis and Babesia bigemina in cattle by Real Time PCR and molecularcharacterization of the isolates". Ankara Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi 62 (2015 ): 27-35 |
RIS | TY - JOUR T1 - Sığırlarda Babesia bovis ve Babesia bigemina'nın Real-Time PCR ile araştırılması ve izolatların moleküler karakterizasyonu AU - ÖnderDüzlü, AlparslanYıldırım, Abdullahİnci, HamzaAvcıoğlu, İbrahimBalkaya Y1 - 2015 PY - 2015 N1 - doi: 10.1501/Vetfak_0000002654 DO - 10.1501/Vetfak_0000002654 T2 - Ankara Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi JF - Journal JO - JOR SP - 27 EP - 35 VL - 62 IS - 1 SN - 1300-0861-1308-2817 M3 - doi: 10.1501/Vetfak_0000002654 UR - https://doi.org/10.1501/Vetfak_0000002654 Y2 - 2023 ER - |
EndNote | %0 Ankara Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi Investigation of Babesia bovis and Babesia bigemina in cattle by Real Time PCR and molecularcharacterization of the isolates %A Önder Düzlü , Alparslan Yıldırım , Abdullah İnci , Hamza Avcıoğlu , İbrahim Balkaya %T Investigation of Babesia bovis and Babesia bigemina in cattle by Real Time PCR and molecularcharacterization of the isolates %D 2015 %J Ankara Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi %P 1300-0861-1308-2817 %V 62 %N 1 %R doi: 10.1501/Vetfak_0000002654 %U 10.1501/Vetfak_0000002654 |
ISNAD | Düzlü, Önder , Yıldırım, Alparslan , İnci, Abdullah , Avcıoğlu, Hamza , Balkaya, İbrahim . "Investigation of Babesia bovis and Babesia bigemina in cattle by Real Time PCR and molecularcharacterization of the isolates". Ankara Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi 62 / 1 (Mart 2015): 27-35 . https://doi.org/10.1501/Vetfak_0000002654 |
AMA | Düzlü Ö. , Yıldırım A. , İnci A. , Avcıoğlu H. , Balkaya İ. Investigation of Babesia bovis and Babesia bigemina in cattle by Real Time PCR and molecularcharacterization of the isolates. Ankara Univ Vet Fak Derg. 2015; 62(1): 27-35. |
Vancouver | Düzlü Ö. , Yıldırım A. , İnci A. , Avcıoğlu H. , Balkaya İ. Investigation of Babesia bovis and Babesia bigemina in cattle by Real Time PCR and molecularcharacterization of the isolates. Ankara Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi. 2015; 62(1): 27-35. |
IEEE | Ö. Düzlü , A. Yıldırım , A. İnci , H. Avcıoğlu ve İ. Balkaya , "Investigation of Babesia bovis and Babesia bigemina in cattle by Real Time PCR and molecularcharacterization of the isolates", Ankara Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi, c. 62, sayı. 1, ss. 27-35, Mar. 2015, doi:10.1501/Vetfak_0000002654 |